1、產生罰款和滯納金
納稅人未及時進行納稅申報，稅務部門將根據實際情況對逾期行為作出處罰。如果納稅人還存在應納稅額的情況下，還將按照每日萬分之五征收滯納金。
2、無法在網上報稅
在申報期的情況下，公司可以在網上完成公司的抄報稅、申報、清卡等事項。如果過了申報期，公司就只能攜帶資料到主管稅務部門的稅務服務廳進行納稅申報辦理。
3、影響企業納稅信用等級
未按規定期限納稅申報的，按每稅種每次扣5分計算。公司如果未按照規定期限進行納稅申報，在納稅信用等級評定的時候會根據逾期次數進行扣分，影響公司的納稅信用等級。
4、被列為非正常戶
公司如果已經辦理稅務登記的納稅人，未在規定的期限內進行申報納稅，收到稅務機關責令修改的通知后，還是未改正，并且聯系不到公司的情況的納稅人，就會將其列入非正常戶。企業被列入非正常戶，相關人員將在全國范圍內無法開辦新公司和相關股權轉移，并且公司將被暫停稅務登記證、發票領購簿和發票的使用。如果被列入非正常戶認定超過3個月的，稅務機關可宣布稅務登記證失效。出口企業被列入非正常戶，稅務機關對企業暫不辦理出口退稅。納稅人申請解除非正常戶，稅務機關可按規定對其處以罰款，有非正常戶記錄的納稅人，本年度直接評定為D級并承擔D級納稅人后果。
