實際上，一般納稅人代理記賬收費高于小規模納稅人，其原因主要有三個方面：

1.申報的數量不同。

對于小型納稅人來說，增值稅一般按季度申報，而普通納稅人則按月申報，單從增值稅上看，每年要增加四倍。另外，兩種納稅人每填寫一張申報單的數量也存在較大差距。小型企業只需填寫增值稅申報表.報關單附材料及免稅申報明細。

2.票據處理的難度不一樣。

普通納稅人的營業額普遍高于小規模納稅人，涉及票據較多。代帳公司在每月收到客戶的發票之后，需要對票據進行檢查、整理、整理、制作記帳憑證，這是一項龐大的工作，而且，普通納稅人也需要核證專用增值稅發票。所以，票據的處理相對于小型納稅人來說更為困難。

3.對記賬的規范要求有所不同。

對委托客戶，代理記賬應提供月度銀行對帳單.工資明細.各種過帳文件等。因為相關部門對一般納稅人的會計工作有很高的要求，所以財務人員處理起來比較謹慎。而且，由于小型納稅人對小型納稅人的要求相對寬松，所以小型納稅人的賬目要簡單一些。因此二者的收費不同。