申請高新企業門檻還是比較高的，很多企業在高新申報時，還是經常被相關部門否定，認證通不過。這其中的原因，主要有以下幾個方面：

一是領域不符合，企業所屬行業屬傳統及淘汰行業；

二是企業缺乏核心自主知識產權；

三是研發項目缺乏科學的設計和安排；

四是研發費用未按認定辦法的要求歸集，且比例難以達到認定要求；

第五是高新產品或服務收入比例較低；

第六是缺乏嚴格規范的研發體系和相應的組織管理安排等。

另外，很多企業由于是申報高新科技項目，對高新申報過程和材料編寫缺乏經驗，對政策了解不透徹等，也容易導致申報失敗。這時候，聘請專業的高新申報服務機構顯得非常必要